招投标管理办公室为副处级建制机构，挂靠国有资产管理处。按照学校规定，为招投标项目的各参与主体提供服务平台，宏观管理学校各项招标采购工作。负责保管、使用和管理“南通大学经济合同专用章”。部门工作职责主要为：

（一）宣传国家相关政策法规、上级文件和学校相关规章制度。

（二）研究起草学校招标采购管理办法及其实施细则。

（三）建设、管理、维护评标专家库。

（四）审核招标公告、招标文件，发布招标、中标信息。

（五）建立和维护学校招投标管理信息网站。

（六）指导各单位（部门）分散采购工作。

（七）协助处理招标采购工作的有关问题。

（八）组建评标工作组，抽取并通知专家评委。

（九）管理开标、评标过程。

（十）审核项目合同。

（十一）使用和管理“南通大学经济合同专用章”。

（十二）对各类招投标活动、大额资金追加、合同变更等实施监督。